يتضمّن معهد علم الأمراض وطب المختبر مختبر علم الأمراض الطبي ومختبراً مرجعياً لعلم الأمراض التشريحي . ويتولّى المختبر المرجعي الوطني، التابع لشبكة مبادلة للمرافق الصحية عالمية المستوى، إدارة الجانب التقني من مختبر علم الأمراض التشريحي ومسؤولية التحاليل والاختبارات المخبرية التي تتمّ إحالتها من كليفلاند كلينك أبوظبي.
وكلا المختبرين حائزان على شهادة الكليّة الأمريكية لعلماء الأمراض التي ترمز إلى أعلى معايير الجودة في إجراء الفحوصات المخبرية الطبية.